Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Taf4E9QAP7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Taf4E9QAP7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Taf4E9QAP7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Taf4E9QAP7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms