Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rdh16f1E9Q9P8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rdh16f1E9Q9P8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rdh16f1E9Q9P8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rdh16f1E9Q9P8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rdh16f1E9Q9P8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rdh16f1E9Q9P8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rdh16f1E9Q9P8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rdh16f1E9Q9P8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh16f1E9Q9P8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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