Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Pdzd2E9Q1M1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Pdzd2E9Q1M1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Pdzd2E9Q1M1 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms