Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms