Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms