Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms