Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc6D3YZP9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms