Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms