Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms