Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11cB4XVP9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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