Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms