Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PtprbB2RU80 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PtprbB2RU80 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PtprbB2RU80 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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PtprbB2RU80 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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PtprbB2RU80 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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PtprbB2RU80 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PtprbB2RU80 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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