Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms