Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms