Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skint4A7TZF3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms