Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ38

Gm13941, Predicted gene 13941 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13941A2AJ38 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13941A2AJ38 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms