Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms