Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms