Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z101

Pard6a, Partitioning defective 6 homolog alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6aQ9Z101 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pard6aQ9Z101 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms