Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf4Q9QZS2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf4Q9QZS2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf4Q9QZS2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf4Q9QZS2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf4Q9QZS2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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