Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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