Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms