Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl4Q9DCU6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl4Q9DCU6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl4Q9DCU6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl4Q9DCU6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl4Q9DCU6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl4Q9DCU6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl4Q9DCU6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl4Q9DCU6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl4Q9DCU6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl4Q9DCU6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl4Q9DCU6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms