Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmgn3Q9DCB1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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