Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Rnf6Q9DBU5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Rnf6Q9DBU5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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