Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Platr25-206ENSMUST00000222303 1171 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 AC123738.1-201ENSMUST00000224796 773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm11817-201ENSMUST00000155578 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm21049-201ENSMUST00000197078 987 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Riok3Q9DBU3 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms