Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ftsj3Q9DBE9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms