Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Smg9Q9DB90 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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