Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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