Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Q9D8L0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Q9D8L0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Q9D8L0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8L0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms