Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Q9D7E4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Q9D7E4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms