Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klhl40Q9D783 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klhl40Q9D783 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klhl40Q9D783 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klhl40Q9D783 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl40Q9D783 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl40Q9D783 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl40Q9D783 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl40Q9D783 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl40Q9D783 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl40Q9D783 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl40Q9D783 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl40Q9D783 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl40Q9D783 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl40Q9D783 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl40Q9D783 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl40Q9D783 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl40Q9D783 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl40Q9D783 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms