Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3404Q9D506 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms