Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap53Q9D439 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap53Q9D439 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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