Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms