Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms