Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Sgo1Q9CXH7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Sgo1Q9CXH7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Sgo1Q9CXH7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Sgo1Q9CXH7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Sgo1Q9CXH7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Sgo1Q9CXH7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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