Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rprd1bQ9CSU0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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