Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Msmo1Q9CRA4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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