Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nicn1Q9CQM0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nicn1Q9CQM0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms