Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms