Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2a1Q99PM3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2a1Q99PM3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms