Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrbp1Q99PL5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms