Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms