Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gdpd3Q99LY2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms