Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms