Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spdl1Q923A2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms