Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms