Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms