Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csde1Q91W50 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms